漳州市疾病预防控制中心位于漳州市龙文区龙祥中路43号，其前身为漳州市卫生防疫站，1987年11月，经上级批准升格为副处级。2004年4月，全市卫生体制改革，通过剥离卫生监督职能，由原漳州市卫生防疫站、市结核病防治所、市健康教育所组建更名为漳州市疾病预防控制中心（简称市CDC），属市级公益一类事业单位。主要承担着全市的突发公共卫生事件应急处置，各种传染病、地方病、慢性病、寄生虫病、职业病的预防控制，各种健康危害因素的预警监测和评价，从业人员健康监护，以及健康教育和健康促进，预防医学科研和教学等任务。中心设有10个业务科室和2个行政职能科室，包括办公室、行政科、传染病防治科、地方病与慢病科、卫生技术服务与消毒杀虫科、职业病与化学中毒防治科、预防性健康体检科、结核病控制科、健康教育科、检验科（卫生检验检测中心）、艾滋病与性病预防控制科、食品卫生与业务质管科等12个科室。 漳州市疾病预防控制中心认真贯彻“预防为主”卫生方针，实施“健康中国”发展战略，努力为人民群众提供全生命周期的卫生与健康服务，中心以“一切为了人民的身体健康”为宗旨，爱岗敬业，热情服务，开拓进取，争创一流。认真开展各项疾病预防控制工作，科学、敏感、快速处置各类突发公共卫生事件，有力地推动了漳州市卫生事业的发展，为建设富美漳州、健康漳州作出了应有的贡献。近年来，先后获得福建省卫生计生系统先进集体、金砖国家领导人第九次会晤筹备和服务保障工作先进集体、福建省“十二五”地方病防治先进集体、福建省食品安全风险监测工作先进集体、福建省免疫规划工作先进单位、漳州市文明单位、漳州市卫计系统先进基层党组织等光荣称号；在专业技术方面，取得福建省卫生应急技能竞赛团体三等奖、漳州市科学技术进步奖三等奖、以及漳州市自然科学基金及漳州市重大科技项目立项等优异成绩。